Совместные проекты

Использование геномики и биоинформатики для улучшения и создания естественных сортов сельскохозяйственных культур.
Наши партнеры ‒ Университет Южной Калифорнии и Университет Калифорнии Дэвис (США) и Всероссийский институт генетических ресурсов растений (ВИР, Санкт-Петербург, Россия)

Мы создали партнерство, чтобы выявлять гены, необходимые для улучшения сортов ряда сельско-хозяйственных культур в плане их адаптации к конкретным природным условиям. Современные элитные сорта плохо адаптируются к изменeнию климата, поскольку утратили нужные для этого гены. Исправить это можно путем повторного введения таких генов в сорта. Для этого мы используем уникально ценную коллекцию генов растений ВИР, отражающую генетическое и функциональное разнообразие культур вековой давности в районах их произрастания. Там хранятся сотни тысяч образцов всех основных сельскохозяйственных растений, хорошо описанных по важным агрономическим признакам. Мы используем методы современной геномики и вычислительные ресурсы, чтобы охарактеризовать коллекцию ВИР, связывая важные адаптивные свойства растений с генами. Это поможет справиться с серьезными проблемами сельского хозяйства 21-го века.

Популяционная геномика и анализ селекционно значимых признаков маша (Vigna radiata) и урда (Vigna mungo) из коллекций ВИР (Россия) и WorldVeg (Тайвань).

Наши партнеры ‒ университет Тайваня (Тайвань), Университеты Южной Калифорнии и штата Вермонт (США), а также Всероссийский институт генетических ресурсов растений (ВИР), Санкт-Петербург, Россия.

Проект направлен на создание нового подхода к оценке и рациональному использованию генетических ресурсов ценных зернобобовых культур – маша (Vigna radiata) и урда (Vigna mungo), на выявление внутривидовой генетической изменчивости селекционно значимых признаков и поиск генов-кандидатов для селекции посредством сочетания методов фенотипирования, геномики и биоинформатики. Наряду с практическими задачами, мы будем разрабатывать новые математические методы и алгоритмы, чтобы понять Как реконструировать историю окультуривания видов? Как идентифицировать и аннотировать мутации, накопленные культурными формами за последнее столетие? Как выявить в геноме закономерности реакции на отбор и идентифицировать аллели, обеспечивающие адаптацию растений к условиям среды?

Разработка прототипа инновационной программы селекции и использование генетического разнообразия сортов коллекции Всероссийского института генетических ресурсов им. Н.И.Вавилова для селекционного улучшения сои в целях обеспечения продовольственной безопасности России.
Совместно с Всероссийским институтом генетических ресурсов растений (ВИР), Санкт-Петербург, и Индустриальным партнером ‒ ООО “Соевый комплекс”, Краснодар Россия.

Целью проекта является применение и разработка новых биоинформатических и статистических методов и программ для oптимизации селекции стратегической сельскохозяйственной культуры — сои с целью опережающего импортозамещения и обеспечения продовольственной безопасности России и создания селекционного материала для конструирования новых сортов этой культуры, обладающих улучшенным комплексом показателей хозяйственно-полезных признаков относительно лучших отечественных аналогов.

Контакты

Телефоны: +7 (812) 290-96-42
+7 (812) 290-96-45

Адрес: г. Санкт- Петербург, ул. Политехническая, 29АФ

compbio@sbpstu.ru

Остались вопросы?

Либо напишите нам compbio@sbpstu.ru