Семинар «‎Анализ возрастных изменений альтернативного сплайсинга в коре головного мозга высших приматов», 28.02.2019

Альтернативный сплайсинг позволяет одному гену кодировать несколько мРНК и, соответственно, белков. По современным данным фактически все многоэкзонные гены человека сплайсируются альтернативно. Известно, что альтернативный сплайсинг эволюционирует очень быстро и в большинстве случаев межвидовые отличия доминируют над межтканевыми. Несмотря на низкую общую консервативность альтернативного сплайсинга, было показано, что тканеспецифичный сплайсинг эволюционно консервативен и функционально важен в развитии нервной и мышечной тканей, а также в созревании половых клеток. В своём докладе Павел расскажет про метод SAJR предназначенный для статистического анализа альтернативного сплайсинга на основании данных РНК-Сек и про применение его к постнатальному развитию мозга высших приматов. Результаты показывают, что хотя межвидовые отличия в альтернативном сплайсинге доминируют над возрастными, последние консервативны между человеком и макакой. Докладчику удалось обнаружить мутации вызвавшие высокоамплитудные межвидовые отличия и найти факторы сплайсинга вероятно отвечающие за возрастные изменения альтернативного сплайсинга.

Павел так же расскажет про ещё незавершённый проект посвящённый анализу регуляции альтернативного сплайсинга в различных тканях в ходе пренатального развития млекопитающих.