Экспрессия гена

Одним из важнейших процессов в клетках всех организмов является экспрессия генов, в результате которой информация, заложенная в гене, считывается и реализуется в виде продуктов экспрессии (молекул мРНК и белков). Транскрипция генов регулируется белками, называемыми транскрипционными факторами. В результате диффузии внутри клетки эти факторы связываются с ДНК и, двигаясь вдоль неё, находят специфичные места посадки (сайты) на ДНК, где остаются связанными с ДНК довольно продолжительное время. Начало и интенсивность транскрипции зависит от молекулярных конфигураций, которые образуются из транскрипционных факторов, связанных со своими специфичными сайтами на ДНК. Поэтому понимание деталей того, как эти конфигурации образуются и насколько они устойчивы, важно для понимания регуляции активности генов. Все процессы, вовлечённые в этот процесс, зависят от многих случайных событий, поэтому для их моделирования используют стохастические модели. Такие модели используют вероятностный язык для описания процессов, в отличие от детерминистских моделей, в которых исход любого процесса в любой момент строго определён. В проекте разрабатывается стохастическая модель, которая применяется на экспериментальных данных, полученных из развивающихся эмбрионов мушки дрозофилы.